Luego de la Publicación del Decreto de Creación de la Universidad Técnica Luís Vargas Torres de Esmeraldas, emitido en el Registro Oficial del 21 de mayo de 1970, se produjeron discrepancias entre algunos alumnos de la Extensión de la Facultad de Ciencias Agropecuarias de la Universidad Central del Ecuador y  los dirigentes del Comité PRO-CREACIÓN del Alma Máter Esmeraldeña, por las dificultades administrativas que se debían de superar para lograr su funcionamiento, se paralizaron las actividades al igual que la dependiente de la Facultad de Ciencias de la Educación de la Universidad Laica Vicente Rocafuerte, que retiró la autorización concedida a la UNE Provincial para su funcionamiento.

El Dr. Segundo Salas Meza, voluntariamente buscó mediar para superar ciertas deficiencias de criterios sobre los trámites que se debían seguir, el tres de junio se integro la Comisión de Gestión para lograr la iniciación de labores en la naciente institución de Educación Superior esmeraldeña, Monseñor Ángel Barbizotty. Ing. Iván Moreno G, Lic. Enrique Suárez P., integraron la citada comisión, con Edgar García Pérez, Lic. Alfredo Pinargoti Cevallos y los estudiantes César Mera Beltrán  y Marcel Pérez Estupiñán. Se logró la autorización para la transferencia de la totalidad de los recursos económicos a nombre de la Universidad Técnica de Esmeraldas Luis Vargas Torres, ya que pertenecían a la Universidad Central; se obtuvo del Ministerio de Finanzas el envió de los recursos económicos, además tenía como misión organizar el proceso para designar a a las autoridades.

El 12 de enero de 1971, tras la ratificación de clausura de la Universidad Central se dejaba sin efecto el impedimento de las actividades de las demás. Durante el régimen de facto, al comité de gestión tuvo dificultades para mantener su actividad, la situación mejoró cuando se nombraron alcaldes, prefectos, concejales, consejeros en los comicios de junio, rápidamente se convocó a los profesores y estudiantes a reunirse para realizar elecciones, durante los días 15 y 16 de agosto, para nombrar representantes a la Asamblea Universitaria y al Consejo Universitario.

La Asamblea Universitaria se reunió en la noche del 17 de agosto y procedió de acuerdo a lo dispuesto en el Decreto de Creación del Alma Máter Esmeraldeña Dr. Luís Prado Viteri y como Vicerrector al Ing. Luís Zatizabal Maldonado, otro hombre de acrisolada honorabilidad, el Medico Veterinario Sigifredo Saavedra Mendoza, fue nombrado representante a la Asamblea al Consejo Superior Universitario, en el cual se encontraban el Ing. Iván Moreno Galárraga, Decano de la Facultad de Ciencias Agropecuarias, el Licenciado Alfredo Pinargoti Cevallos, Decano de la Facultad de Ciencias de la Educación, representantes estudiantiles Gilberto Mejía Mórales por agropecuarias y Marcel Pérez Estupiñán Por Ciencias de la Educación.

La designación del primer Rector de la Universidad Luís Vargas Torres, en la persona del Dr. Luís Prado Viteri, fue en reconocimiento a sus virtudes cívicas, humana y acrisolada honradez, siempre puestas al servicio de la colectividad que en ocasiones no le supo comprender ni respaldar, la labor cumplida al frente de la Universidad Técnica Luís Vargas Torres, en su proceso de organización es admirable y debe constituirse en el ejemplo a seguir por los quienes desempeñan las funciones que el honró.
Sus colaboradores fueron personas de conocida solvencia moral y los funcionarios y empleados que venían ya laborando en la extensión universitaria les obligo a seguir sus lineamientos.
El problema de local se lo solucionó habilitando aulas en un edifico de tres plantas ubicado en la Avenida Libertad entre Espejo y Rioverde; las oficinas de administración central estuvieron ubicadas frente al anterior, al igual que las aulas del Colegio Margarita Cortes y Luís Tello.
El personal de catedráticos fue escogido con mucho tino, considerando su calidad por medio de concurso de merecimiento y oposición de cátedra, y a pesar de no contar con un Estatuto a manera de guía se decidió seguir las normas de las universidades más antiguas.
La Escuela de Administración que inició adscrita a la Facultad de Ciencias de la Educación, facilitó la creación de la Facultad el 27 de septiembre de 1971.
En aquellos tiempos todo el profesorado de la universidad Técnica Luís Vargas Torres, se esforzaba por cumplir su labor, era, exigente y puntual, rara, rarísima, era la ocasión en la cual no acudía a clases, en donde la mayoría de estudiantes buscaban superarse.
En marzo de 1971, Tomas Gastelú, se acerco al rectorado de la Universidad con la finalidad de ofrecer en venta la hacienda Mútile de 884 hectáreas, el Dr. Prado, conocía la propiedad y sus bondades para el establecimiento de una Estación Experimental, Prado Viteri, después de la sesión de Consejo Superior Universitario del 9 de marzo se resolvió que se haría la adquisición con los fondos existentes y, el 28 de julio el en otra reunión de Consejo Universitario se autorizó la adquisición en 1’100.00 sucres, suscribiéndose el contrato de compra venta el 10 de agosto del mismo año.
La construcción de la ciudadela universitaria fue otro de los afanes del Dr. Luís Prado Viteri, quien logró el 4 de agoto la adquisición de 40 hectáreas en La Propicia por $ 190.000 a la Universidad de Esmeraldas